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湖北武汉17中教室门服了!菲沙的HiC质控标准竟然如此严格!-菲沙基因

33 全部文章 | 2018年03月03日
服了!菲沙的HiC质控标准竟然如此严格易图网!廖晓乔-菲沙基因

Hi-C技术能够获得全基因组范围内所有基因之间的互作信息,从而揭示基因的空间远程调控机制李安琦,并绘制染色质三维空间结构模型无限武道求索。准确的信息分析结果花脸雪糕,源于良好的实验数据的获得湖北武汉17中教室门筱田建市,由于Hi-C技术对实验操作的要求较高,为了准确评估实验过程的无误性,追踪溯源长天烽火,因此每一步实验后都应该有相应的质控检测。小编见识过Hi-C严格的质控标准,但没想到菲沙基因的Hi-C质控标准竟然如此严格!
Hi-C实验原理

1)使用细胞交联剂多聚甲醛处理细胞慈急医院,固定DNA的构象;
2)细胞裂解后,利用限制性内切酶处理交联的DNA,产生粘性末端;
3)末端补平修复,同时引入生物素标记;
4)使用DNA连接酶连接临近的DNA片段;
5)蛋白酶消化解除与DNA的交联状态彭嘉欣,捕获DNA进行建库测序。
菲沙基因质控点
为了保证实验的成功,菲沙对各个实验步骤产生的结果均会进行电泳检测质控。由于测序数据中,只有含有酶切位点的片段才是我们真正需要的数据丁文婷,菲沙对酶切位点数据比例的质控要求竟高达80%以上,且顺式互作强度通常情况下会大于反式互作强度盛唐刑官,这才能说明整个Hi-C实验过程的成功,因此在获得小数据量测序结果后黑糖三部曲,我们还会对酶切位点比例以及顺反式互作比例进行评估。

不多说了,有图有真相,直接show一张完美的电泳检测胶图。

在获得正式大量测序数据之后,由于酶切连接的过程会不可避免的产生同一片段自连和非交联片段随机连接,后续分析流程中我们均会采用严格的质控标准新志甜文,过滤掉这些无效数据屈服心裳,从而获得高质量的基因互作信息。

菲沙基因技术团队在国内率先开展三维基因组研究,开发了完善的Hi-C实验及数据分析流程赵怀安,具有丰富的项目经验,开展的Hi-C项目涵盖细菌、古菌、真菌、软体动物、鱼类、哺乳动物细胞系、人类癌症细胞系等物种黄子忠,可为广大科研学者提供高水平的三维基因组学研究服务。

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